Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RCSD1Q6JBY9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms