Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
CARMIL2Q6F5E8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CARMIL2Q6F5E8 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms