Protein–RNA interactions for Protein: Q63HN8

RNF213, E3 ubiquitin-protein ligase RNF213, humanhuman

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Length 5,207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF213Q63HN8 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RNF213Q63HN8 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RNF213Q63HN8 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RNF213Q63HN8 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RNF213Q63HN8 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RNF213Q63HN8 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RNF213Q63HN8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RNF213Q63HN8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RNF213Q63HN8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RNF213Q63HN8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RNF213Q63HN8 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RNF213Q63HN8 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RNF213Q63HN8 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RNF213Q63HN8 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RNF213Q63HN8 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RNF213Q63HN8 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RNF213Q63HN8 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RNF213Q63HN8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RNF213Q63HN8 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RNF213Q63HN8 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RNF213Q63HN8 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RNF213Q63HN8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RNF213Q63HN8 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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