Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AGAP6Q5VW22 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms