Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDLRAD1Q5T700 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDLRAD1Q5T700 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms