Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NHSL1Q5SYE7 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NHSL1Q5SYE7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms