Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CEP170Q5SW79 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CEP170Q5SW79 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CEP170Q5SW79 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CEP170Q5SW79 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CEP170Q5SW79 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CEP170Q5SW79 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CEP170Q5SW79 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CEP170Q5SW79 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CEP170Q5SW79 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CEP170Q5SW79 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CEP170Q5SW79 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CEP170Q5SW79 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CEP170Q5SW79 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CEP170Q5SW79 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CEP170Q5SW79 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CEP170Q5SW79 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
CEP170Q5SW79 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CEP170Q5SW79 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
CEP170Q5SW79 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CEP170Q5SW79 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CEP170Q5SW79 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CEP170Q5SW79 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
CEP170Q5SW79 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CEP170Q5SW79 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CEP170Q5SW79 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CEP170Q5SW79 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CEP170Q5SW79 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CEP170Q5SW79 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CEP170Q5SW79 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CEP170Q5SW79 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
CEP170Q5SW79 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CEP170Q5SW79 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CEP170Q5SW79 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CEP170Q5SW79 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
CEP170Q5SW79 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CEP170Q5SW79 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CEP170Q5SW79 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CEP170Q5SW79 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CEP170Q5SW79 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CEP170Q5SW79 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CEP170Q5SW79 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CEP170Q5SW79 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CEP170Q5SW79 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CEP170Q5SW79 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
CEP170Q5SW79 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
CEP170Q5SW79 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
CEP170Q5SW79 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
CEP170Q5SW79 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
CEP170Q5SW79 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
CEP170Q5SW79 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms