Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP188Q5SRE5 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP188Q5SRE5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms