Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4orf17Q53FE4 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms