Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVEP1Q4LDE5 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms