Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00303Q3SY05 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms