Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LAMA3Q16787 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA3Q16787 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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