Protein–RNA interactions for Protein: Q16553

LY6E, Lymphocyte antigen 6E, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY6EQ16553 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LY6EQ16553 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LY6EQ16553 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LY6EQ16553 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LY6EQ16553 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LY6EQ16553 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LY6EQ16553 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LY6EQ16553 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LY6EQ16553 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LY6EQ16553 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LY6EQ16553 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LY6EQ16553 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LY6EQ16553 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LY6EQ16553 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LY6EQ16553 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LY6EQ16553 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LY6EQ16553 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LY6EQ16553 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LY6EQ16553 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LY6EQ16553 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LY6EQ16553 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LY6EQ16553 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LY6EQ16553 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LY6EQ16553 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LY6EQ16553 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LY6EQ16553 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms