Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CHRNA6Q15825 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNA6Q15825 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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