Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALX1Q15699 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
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