Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCEA2Q15560 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCEA2Q15560 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCEA2Q15560 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCEA2Q15560 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCEA2Q15560 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCEA2Q15560 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCEA2Q15560 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCEA2Q15560 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCEA2Q15560 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCEA2Q15560 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCEA2Q15560 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCEA2Q15560 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCEA2Q15560 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCEA2Q15560 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCEA2Q15560 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCEA2Q15560 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TCEA2Q15560 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TCEA2Q15560 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TCEA2Q15560 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TCEA2Q15560 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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