Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRKQ15262 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRKQ15262 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
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