Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LAPTM4AQ15012 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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