Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
COL9A3Q14050 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL9A3Q14050 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
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