Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2H2Q13888 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
GTF2H2Q13888 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GTF2H2Q13888 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GTF2H2Q13888 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2H2Q13888 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2H2Q13888 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2H2Q13888 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2H2Q13888 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2H2Q13888 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2H2Q13888 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2H2Q13888 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2H2Q13888 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2H2Q13888 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2H2Q13888 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2H2Q13888 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2H2Q13888 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2H2Q13888 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2H2Q13888 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2H2Q13888 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2H2Q13888 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2H2Q13888 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2H2Q13888 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2H2Q13888 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2H2Q13888 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2H2Q13888 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2H2Q13888 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2H2Q13888 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2H2Q13888 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2H2Q13888 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2H2Q13888 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2H2Q13888 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2H2Q13888 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2H2Q13888 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2H2Q13888 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2H2Q13888 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2H2Q13888 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2H2Q13888 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2H2Q13888 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2H2Q13888 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2H2Q13888 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2H2Q13888 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms