Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SPTAN1Q13813 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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