Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LAMB3Q13751 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LAMB3Q13751 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
LAMB3Q13751 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
LAMB3Q13751 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
LAMB3Q13751 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
LAMB3Q13751 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LAMB3Q13751 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LAMB3Q13751 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LAMB3Q13751 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LAMB3Q13751 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LAMB3Q13751 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LAMB3Q13751 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LAMB3Q13751 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LAMB3Q13751 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LAMB3Q13751 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LAMB3Q13751 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LAMB3Q13751 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LAMB3Q13751 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LAMB3Q13751 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms