Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGA7Q13683 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGA7Q13683 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGA7Q13683 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGA7Q13683 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGA7Q13683 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGA7Q13683 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGA7Q13683 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGA7Q13683 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGA7Q13683 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGA7Q13683 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGA7Q13683 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGA7Q13683 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGA7Q13683 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGA7Q13683 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGA7Q13683 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGA7Q13683 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGA7Q13683 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGA7Q13683 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGA7Q13683 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGA7Q13683 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGA7Q13683 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGA7Q13683 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGA7Q13683 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGA7Q13683 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGA7Q13683 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGA7Q13683 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGA7Q13683 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGA7Q13683 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGA7Q13683 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGA7Q13683 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGA7Q13683 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGA7Q13683 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGA7Q13683 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
ITGA7Q13683 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
ITGA7Q13683 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGA7Q13683 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.2 ms