Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AP3B2Q13367 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms