Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NME3Q13232 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NME3Q13232 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NME3Q13232 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NME3Q13232 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NME3Q13232 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NME3Q13232 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NME3Q13232 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NME3Q13232 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NME3Q13232 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NME3Q13232 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NME3Q13232 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NME3Q13232 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NME3Q13232 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NME3Q13232 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NME3Q13232 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NME3Q13232 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NME3Q13232 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NME3Q13232 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NME3Q13232 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NME3Q13232 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NME3Q13232 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NME3Q13232 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NME3Q13232 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NME3Q13232 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NME3Q13232 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NME3Q13232 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NME3Q13232 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NME3Q13232 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NME3Q13232 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NME3Q13232 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NME3Q13232 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NME3Q13232 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NME3Q13232 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NME3Q13232 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NME3Q13232 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NME3Q13232 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NME3Q13232 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NME3Q13232 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NME3Q13232 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NME3Q13232 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NME3Q13232 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NME3Q13232 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NME3Q13232 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NME3Q13232 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NME3Q13232 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NME3Q13232 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NME3Q13232 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NME3Q13232 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NME3Q13232 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NME3Q13232 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NME3Q13232 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NME3Q13232 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NME3Q13232 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NME3Q13232 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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NME3Q13232 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NME3Q13232 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NME3Q13232 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NME3Q13232 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
NME3Q13232 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NME3Q13232 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
NME3Q13232 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NME3Q13232 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NME3Q13232 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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NME3Q13232 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NME3Q13232 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NME3Q13232 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NME3Q13232 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
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NME3Q13232 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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NME3Q13232 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NME3Q13232 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NME3Q13232 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NME3Q13232 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NME3Q13232 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NME3Q13232 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NME3Q13232 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NME3Q13232 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NME3Q13232 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NME3Q13232 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NME3Q13232 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NME3Q13232 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NME3Q13232 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NME3Q13232 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NME3Q13232 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NME3Q13232 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NME3Q13232 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NME3Q13232 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NME3Q13232 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NME3Q13232 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NME3Q13232 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NME3Q13232 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NME3Q13232 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NME3Q13232 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NME3Q13232 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NME3Q13232 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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