Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GPS1Q13098 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
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