Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TWF1Q12792 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TWF1Q12792 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TWF1Q12792 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TWF1Q12792 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TWF1Q12792 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TWF1Q12792 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TWF1Q12792 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TWF1Q12792 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TWF1Q12792 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TWF1Q12792 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TWF1Q12792 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TWF1Q12792 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TWF1Q12792 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TWF1Q12792 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TWF1Q12792 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TWF1Q12792 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TWF1Q12792 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TWF1Q12792 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TWF1Q12792 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TWF1Q12792 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TWF1Q12792 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TWF1Q12792 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TWF1Q12792 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TWF1Q12792 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TWF1Q12792 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TWF1Q12792 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TWF1Q12792 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TWF1Q12792 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TWF1Q12792 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TWF1Q12792 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TWF1Q12792 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TWF1Q12792 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TWF1Q12792 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TWF1Q12792 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms