Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SREBF2Q12772 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SREBF2Q12772 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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