Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LRP1Q07954 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms