Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CHRNDQ07001 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNDQ07001 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms