Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FMODQ06828 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FMODQ06828 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FMODQ06828 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FMODQ06828 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FMODQ06828 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FMODQ06828 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FMODQ06828 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FMODQ06828 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FMODQ06828 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FMODQ06828 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FMODQ06828 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FMODQ06828 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FMODQ06828 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FMODQ06828 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FMODQ06828 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FMODQ06828 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FMODQ06828 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FMODQ06828 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FMODQ06828 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FMODQ06828 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FMODQ06828 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FMODQ06828 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FMODQ06828 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FMODQ06828 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FMODQ06828 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FMODQ06828 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FMODQ06828 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FMODQ06828 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FMODQ06828 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FMODQ06828 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FMODQ06828 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FMODQ06828 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FMODQ06828 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FMODQ06828 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FMODQ06828 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FMODQ06828 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FMODQ06828 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FMODQ06828 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FMODQ06828 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FMODQ06828 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FMODQ06828 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FMODQ06828 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FMODQ06828 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FMODQ06828 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FMODQ06828 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FMODQ06828 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FMODQ06828 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FMODQ06828 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FMODQ06828 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FMODQ06828 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FMODQ06828 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FMODQ06828 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FMODQ06828 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FMODQ06828 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FMODQ06828 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FMODQ06828 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FMODQ06828 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FMODQ06828 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FMODQ06828 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FMODQ06828 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FMODQ06828 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FMODQ06828 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FMODQ06828 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FMODQ06828 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FMODQ06828 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FMODQ06828 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FMODQ06828 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FMODQ06828 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FMODQ06828 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FMODQ06828 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FMODQ06828 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FMODQ06828 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FMODQ06828 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FMODQ06828 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FMODQ06828 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FMODQ06828 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FMODQ06828 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FMODQ06828 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FMODQ06828 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FMODQ06828 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FMODQ06828 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FMODQ06828 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FMODQ06828 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FMODQ06828 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FMODQ06828 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FMODQ06828 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FMODQ06828 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FMODQ06828 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FMODQ06828 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FMODQ06828 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FMODQ06828 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FMODQ06828 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FMODQ06828 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FMODQ06828 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FMODQ06828 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FMODQ06828 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FMODQ06828 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FMODQ06828 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FMODQ06828 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms