Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PAX8Q06710 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms