Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LTBQ06643 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LTBQ06643 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LTBQ06643 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LTBQ06643 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LTBQ06643 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LTBQ06643 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LTBQ06643 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LTBQ06643 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LTBQ06643 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LTBQ06643 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LTBQ06643 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LTBQ06643 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LTBQ06643 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LTBQ06643 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LTBQ06643 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LTBQ06643 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LTBQ06643 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LTBQ06643 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LTBQ06643 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LTBQ06643 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LTBQ06643 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LTBQ06643 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LTBQ06643 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LTBQ06643 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LTBQ06643 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LTBQ06643 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LTBQ06643 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LTBQ06643 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LTBQ06643 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LTBQ06643 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LTBQ06643 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LTBQ06643 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LTBQ06643 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LTBQ06643 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LTBQ06643 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LTBQ06643 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LTBQ06643 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LTBQ06643 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LTBQ06643 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LTBQ06643 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LTBQ06643 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LTBQ06643 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LTBQ06643 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LTBQ06643 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LTBQ06643 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LTBQ06643 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LTBQ06643 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LTBQ06643 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LTBQ06643 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LTBQ06643 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LTBQ06643 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBQ06643 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBQ06643 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBQ06643 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBQ06643 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBQ06643 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBQ06643 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBQ06643 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBQ06643 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBQ06643 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBQ06643 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBQ06643 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBQ06643 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBQ06643 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBQ06643 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBQ06643 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBQ06643 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBQ06643 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBQ06643 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBQ06643 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBQ06643 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBQ06643 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBQ06643 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBQ06643 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBQ06643 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBQ06643 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBQ06643 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBQ06643 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBQ06643 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBQ06643 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBQ06643 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBQ06643 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBQ06643 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBQ06643 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBQ06643 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBQ06643 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBQ06643 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBQ06643 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBQ06643 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBQ06643 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBQ06643 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LTBQ06643 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LTBQ06643 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LTBQ06643 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LTBQ06643 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LTBQ06643 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LTBQ06643 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LTBQ06643 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LTBQ06643 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms