Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABPAQ06546 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms