Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CALD1Q05682 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CALD1Q05682 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms