Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN12Q05209 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms