Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSBP1Q04837 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP1Q04837 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms