Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNC4Q03721 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms