Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPEQ02224 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPEQ02224 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms