Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLCB3Q01970 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms