Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTBN1Q01082 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTBN1Q01082 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms