Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGD1P98174 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGD1P98174 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGD1P98174 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGD1P98174 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGD1P98174 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGD1P98174 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGD1P98174 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGD1P98174 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGD1P98174 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGD1P98174 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGD1P98174 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGD1P98174 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGD1P98174 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGD1P98174 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGD1P98174 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGD1P98174 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGD1P98174 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGD1P98174 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGD1P98174 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGD1P98174 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGD1P98174 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGD1P98174 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGD1P98174 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGD1P98174 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGD1P98174 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGD1P98174 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGD1P98174 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGD1P98174 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGD1P98174 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGD1P98174 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGD1P98174 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGD1P98174 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGD1P98174 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGD1P98174 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGD1P98174 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FGD1P98174 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FGD1P98174 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGD1P98174 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGD1P98174 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGD1P98174 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGD1P98174 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGD1P98174 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGD1P98174 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGD1P98174 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGD1P98174 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGD1P98174 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGD1P98174 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGD1P98174 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGD1P98174 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGD1P98174 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGD1P98174 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGD1P98174 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGD1P98174 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGD1P98174 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGD1P98174 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGD1P98174 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGD1P98174 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGD1P98174 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGD1P98174 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGD1P98174 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGD1P98174 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGD1P98174 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGD1P98174 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGD1P98174 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGD1P98174 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGD1P98174 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGD1P98174 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGD1P98174 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGD1P98174 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGD1P98174 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGD1P98174 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGD1P98174 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGD1P98174 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGD1P98174 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGD1P98174 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGD1P98174 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGD1P98174 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGD1P98174 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGD1P98174 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FGD1P98174 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGD1P98174 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGD1P98174 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGD1P98174 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGD1P98174 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGD1P98174 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGD1P98174 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGD1P98174 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGD1P98174 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FGD1P98174 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGD1P98174 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGD1P98174 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGD1P98174 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGD1P98174 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGD1P98174 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGD1P98174 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGD1P98174 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGD1P98174 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FGD1P98174 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGD1P98174 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms