Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRB1P82279 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRB1P82279 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRB1P82279 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRB1P82279 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRB1P82279 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRB1P82279 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CRB1P82279 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRB1P82279 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRB1P82279 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRB1P82279 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRB1P82279 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRB1P82279 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRB1P82279 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRB1P82279 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRB1P82279 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRB1P82279 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRB1P82279 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRB1P82279 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRB1P82279 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRB1P82279 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRB1P82279 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRB1P82279 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRB1P82279 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRB1P82279 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRB1P82279 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRB1P82279 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRB1P82279 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CRB1P82279 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRB1P82279 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CRB1P82279 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CRB1P82279 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRB1P82279 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRB1P82279 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRB1P82279 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRB1P82279 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRB1P82279 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRB1P82279 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRB1P82279 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRB1P82279 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRB1P82279 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRB1P82279 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRB1P82279 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRB1P82279 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRB1P82279 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRB1P82279 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRB1P82279 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRB1P82279 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRB1P82279 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRB1P82279 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRB1P82279 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRB1P82279 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRB1P82279 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRB1P82279 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRB1P82279 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRB1P82279 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRB1P82279 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRB1P82279 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRB1P82279 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRB1P82279 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRB1P82279 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRB1P82279 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRB1P82279 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRB1P82279 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRB1P82279 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRB1P82279 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRB1P82279 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRB1P82279 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CRB1P82279 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRB1P82279 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRB1P82279 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRB1P82279 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRB1P82279 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRB1P82279 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CRB1P82279 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRB1P82279 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRB1P82279 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRB1P82279 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRB1P82279 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRB1P82279 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRB1P82279 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRB1P82279 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRB1P82279 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRB1P82279 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRB1P82279 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRB1P82279 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRB1P82279 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRB1P82279 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRB1P82279 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRB1P82279 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CRB1P82279 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRB1P82279 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRB1P82279 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRB1P82279 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRB1P82279 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRB1P82279 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRB1P82279 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRB1P82279 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRB1P82279 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRB1P82279 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms