Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GFRA1P56159 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms