Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SH3BGRP55822 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms