Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms