Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGDP52209 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGDP52209 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGDP52209 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGDP52209 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGDP52209 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGDP52209 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGDP52209 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGDP52209 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGDP52209 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGDP52209 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGDP52209 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGDP52209 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGDP52209 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGDP52209 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGDP52209 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGDP52209 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGDP52209 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGDP52209 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGDP52209 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGDP52209 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGDP52209 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGDP52209 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGDP52209 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGDP52209 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGDP52209 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGDP52209 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGDP52209 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGDP52209 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGDP52209 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGDP52209 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGDP52209 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGDP52209 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGDP52209 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGDP52209 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PGDP52209 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGDP52209 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGDP52209 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGDP52209 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGDP52209 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGDP52209 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGDP52209 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGDP52209 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGDP52209 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGDP52209 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGDP52209 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGDP52209 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGDP52209 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGDP52209 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGDP52209 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGDP52209 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGDP52209 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGDP52209 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PGDP52209 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PGDP52209 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGDP52209 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PGDP52209 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGDP52209 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGDP52209 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGDP52209 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGDP52209 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGDP52209 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGDP52209 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGDP52209 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGDP52209 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGDP52209 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGDP52209 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGDP52209 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGDP52209 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGDP52209 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGDP52209 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGDP52209 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGDP52209 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGDP52209 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGDP52209 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGDP52209 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGDP52209 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGDP52209 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGDP52209 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGDP52209 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGDP52209 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PGDP52209 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGDP52209 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGDP52209 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGDP52209 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGDP52209 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGDP52209 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PGDP52209 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PGDP52209 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PGDP52209 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGDP52209 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PGDP52209 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PGDP52209 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PGDP52209 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PGDP52209 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PGDP52209 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PGDP52209 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PGDP52209 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGDP52209 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGDP52209 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms