Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms