Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZEB1P37275 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms