Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJA4P35212 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJA4P35212 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJA4P35212 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJA4P35212 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GJA4P35212 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJA4P35212 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GJA4P35212 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GJA4P35212 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GJA4P35212 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GJA4P35212 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GJA4P35212 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GJA4P35212 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GJA4P35212 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GJA4P35212 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GJA4P35212 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GJA4P35212 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GJA4P35212 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GJA4P35212 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GJA4P35212 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GJA4P35212 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GJA4P35212 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GJA4P35212 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GJA4P35212 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GJA4P35212 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GJA4P35212 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GJA4P35212 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GJA4P35212 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GJA4P35212 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GJA4P35212 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GJA4P35212 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GJA4P35212 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GJA4P35212 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GJA4P35212 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GJA4P35212 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GJA4P35212 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GJA4P35212 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GJA4P35212 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GJA4P35212 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GJA4P35212 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GJA4P35212 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GJA4P35212 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GJA4P35212 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GJA4P35212 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GJA4P35212 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GJA4P35212 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GJA4P35212 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GJA4P35212 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GJA4P35212 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GJA4P35212 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GJA4P35212 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GJA4P35212 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GJA4P35212 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GJA4P35212 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GJA4P35212 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GJA4P35212 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GJA4P35212 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GJA4P35212 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GJA4P35212 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GJA4P35212 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GJA4P35212 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GJA4P35212 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GJA4P35212 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GJA4P35212 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GJA4P35212 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GJA4P35212 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GJA4P35212 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GJA4P35212 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GJA4P35212 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GJA4P35212 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GJA4P35212 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GJA4P35212 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GJA4P35212 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GJA4P35212 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GJA4P35212 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GJA4P35212 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GJA4P35212 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GJA4P35212 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GJA4P35212 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GJA4P35212 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GJA4P35212 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GJA4P35212 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GJA4P35212 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GJA4P35212 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GJA4P35212 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GJA4P35212 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GJA4P35212 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GJA4P35212 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GJA4P35212 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GJA4P35212 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GJA4P35212 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GJA4P35212 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GJA4P35212 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GJA4P35212 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GJA4P35212 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GJA4P35212 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GJA4P35212 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GJA4P35212 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GJA4P35212 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GJA4P35212 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms